A Conferência das Partes, reunindo Governos signatários da Convenção, acontece desde 1994, cada ano em um país diferente, funcionando como o fórum que “governa” a implementação da Convenção. O acesso e repartição dos benefícios de uso da biodiversidade, os direitos das populações tradicionais, e medidas para proteção da biodiversidade marinha, florestal e agrícola são alguns dos temas tratados nas COPs. Participam com direito a voto apenas os representantes de Governos que assinaram a Convenção. Diante da relevância dos temas discutidos, países não signatários como os Estados Unidos e lobistas das grandes corporações são freqüentadores assíduos das COPs e trabalham arduamente para obstruir a aprovação de regras e propostas que venham colocar limites aos seus interesses econômicos